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一种RNA-蛋白质复合物的富集和鉴定方法

基本信息

申请号	CN201910890560.1	申请日	-
公开（公告）号	CN110567788B	公开（公告）日	2022-02-11
申请公布号	CN110567788B	申请公布日	2022-02-11
分类号	G01N1/34（2006.01）I;G01N1/40（2006.01）I;G01N27/62（2021.01）I;G01N33/68（2006.01）I;G01N30/06（2006.01）I;G01N30/08（2006.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I	分类	测量；测试;
发明人	秦伟捷;张万军;钱小红;张铮	申请（专利权）人	北京蛋白质组研究中心
代理机构	北京纪凯知识产权代理有限公司	代理人	赵静
地址	102206 北京市昌平区生命科学园路38号
法律状态	-

摘要

本发明提供了一种RNA‑蛋白质复合物富集鉴定方法。所用PB试剂如式I所示，其在365nm波长紫外光照下可与RNA‑蛋白复合物中RNA的嘧啶碱基发生共价反应，从而实现RNA‑蛋白复合物的特异性富集。该富集方法具有如下优势：（1）能够无偏性的对各种不同类型的RNA及其蛋白复合物进行标记和富集，特别是对非编码RNA‑蛋白质复合物的富集鉴定在表观遗传研究领域具有重要意义；（2）PB试剂富集无需代谢标记，对细胞的正常生理状态扰动更少，而且标记效率更高；（3）可应用于组织样本中各种RNA‑蛋白质复合物的全面性研究，（4）乙二醇重复单元作为PB试剂中连接补骨脂素和生物素的连接臂，可有效降低空间位阻，提高链霉素修饰磁珠对RNA‑蛋白质复合物的富集效率。