一种肿瘤突变肽MHC亲和力预测方法及其应用
基本信息
| 申请号 | CN201811448569.9 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109682978B | 公开（公告）日 | 2020-07-03 |
| 申请公布号 | CN109682978B | 申请公布日 | 2020-07-03 |
| 分类号 | C12Q1/6886 | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 丁平 | 申请（专利权）人 | 四川康德赛医疗科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京中政联科专利代理事务所（普通合伙） | 代理人 | 四川康德赛医疗科技有限公司;丁平 |
| 地址 | 610093 四川省成都市高新区科园南路88号12栋201号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提出了一种肿瘤突变肽MHC亲和力的预测方法，包括如下步骤：(一)肿瘤特异性突变序列的获取；(二)对突变肽MHC亲和力预测，以所述突变序列翻译成预定长度的氨基酸FASTA序列，获得测试肽；对所述测试肽分别进行与MHCI分子、MHCII分子的亲和力评估，按照确定的等级标准筛选突变肽；(三)对步骤(二)中筛选出的具有高亲和力所述突变肽，进行蛋白酶体切割预测，筛选出能够被蛋白酶体有效切割的所述突变肽；(四)实验验证实验合成步骤(三)验证突变肽与患者特有MHC的亲和力。本发明还提出了一种基于肿瘤突变肽MHC亲和力的预测方法在筛选肿瘤新生抗原及制备个性化肿瘤疫苗中的用途。 |
