适用于单细胞全基因组甲基化与转录组共测序的文库建立方法及其应用

基本信息

申请号 CN201710867619.6 申请日 -
公开(公告)号 CN107557874A 公开(公告)日 2018-01-09
申请公布号 CN107557874A 申请公布日 2018-01-09
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I 分类 组合技术〔8〕;
发明人 陈昌岳;王芳;李静;张祥林;胡秋萍;段彪;张培培;董东;任一;郑冠涛;路远 申请(专利权)人 上海美吉医学检验有限公司
代理机构 上海光华专利事务所(普通合伙) 代理人 上海美吉医学检验有限公司
地址 200120 上海市浦东新区康新公路3399号3号楼5层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及分子生物学技术领域,具体公开了一种适用于单细胞的全基因组甲基化与转录组共测序的文库建立方法,包括如下步骤:(1)细胞裂解;(2)对细胞裂解液进行反转录,使细胞裂解液中的RNA反转录成为cDNA;(3)步骤(2)处理后的基因组DNA和cDNA分离;(4)以分离后基因组DNA构建甲基化文库,cDNA构建转录组文库;其中,步骤(4)中所述基因组DNA甲基化文库构建包括以下步骤:(4‑1)对所述基因组DNA进行重亚硫酸盐转化;(4‑2)对步骤(4‑1)中转化后的基因组DNA进行线性扩增;(4‑3)对步骤(4‑2)中线性扩增的扩增子进行指数扩增,所述指数扩增的扩增子用作文库。