基于自动设计的引物的高效荧光等位基因特异性聚合酶链式反应方法及检测基因分型方法

基本信息

申请号 CN201610163865.9 申请日 -
公开(公告)号 CN105755125B 公开(公告)日 2019-01-11
申请公布号 CN105755125B 申请公布日 2019-01-11
分类号 C12Q1/6858;C12N15/11;C12N15/10 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 秦鹏飞 申请(专利权)人 深兰国开基因科技(山东)有限公司
代理机构 杭州之江专利事务所(普通合伙) 代理人 杭州精皮士生物技术有限公司;李锐;深兰机器人(山东)有限公司;深兰国开基因科技(山东)有限公司
地址 310000 浙江省杭州市滨江区江南大道3850号创新大厦22楼2203室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种等位基因特异性聚合酶链式反应的自动引物设计方法,还提供了采用上述设计的引物进行高效荧光等位基因特异性聚合酶链式扩展反应的方法及检测基因分型的方法;对于任意SNP位点,取得其上下游40~60bp的序列设计四个内引物,任意一个内引物的设计从3'末端开始,任意一个内引物的3'末端都在单核苷酸多样性位点上有特异性匹配,所述的单核苷酸多样性位点的匹配位点在引物3'末端的-1~-3位;得到内引物后,在每个内引物5’端加一个不与模板特异性匹配的短片段,内引物与短片段共同组成外引物。通过本发明可以在相同的反应条件下实现高的基因分型分析的检测特异性。