基于全基因组重测序和KASP技术开发的烟草SNP标记及其应用

基本信息

申请号 CN202111086019.9 申请日 -
公开(公告)号 CN114507747A 公开(公告)日 2022-05-17
申请公布号 CN114507747A 申请公布日 2022-05-17
分类号 C12Q1/6895(2018.01)I;C12Q1/6858(2018.01)I;C12N15/11(2006.01)I;G16B30/20(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I;G06Q30/00(2012.01)I;G06K19/06(2006.01)I;G06K17/00(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 余世洲;杨志晓;陈勇;王丰;刘胜杰;雷波;任学良;余婧;赵会纳;张剑锋;金静静;王兵 申请(专利权)人 贵州省烟草科学研究院
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人 -
地址 550081贵州省贵阳市观山湖区龙滩坝路29号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了基于全基因组重测序和KASP技术开发的烟草SNP标记及其应用。本发明基于150份烟草全基因组重测序数据,利用前期探索的数据分析方法,挖掘获得了超过百万个SNP位点,对这些位点进一步分析,利用KASP技术平台,鉴定筛选出240个核心SNP标记及配套KASP引物,覆盖了烟草24条染色体/连锁群。本发明为烟草生物学研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP标记,这套SNP标记和检测引物,可用于烟草SNP检测试剂盒开发、烟草品种DNA指纹图谱构建、烟草种质资源和遗传群体基因分型,烟草定向改良品种背景回复率检测、烟草品种纯度/真伪度检测、烟草分子标记辅助选择育种等。