筛选微卫星位点的方法及其应用专利查询专利号|摘要-满商公司网

筛选微卫星位点的方法及其应用

基本信息

申请号	CN202110042650.2	申请日	-
公开（公告）号	CN112662740B	公开（公告）日	2022-06-10
申请公布号	CN112662740B	申请公布日	2022-06-10
分类号	C12Q1/6809（2018.01）I;C12Q1/6858（2018.01）I;C12N15/11（2006.01）I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	常壹昭;肖姗姗;王涛	申请（专利权）人	杭州瑞普基因科技有限公司
代理机构	北京清亦华知识产权代理事务所（普通合伙）	代理人	-
地址	311100浙江省杭州市余杭区五常街道联创街188号贝达梦工场D座7-10层
法律状态	-

摘要

本发明提出一种筛选微卫星位点的方法，该方法包括：（1）对已知微卫星稳定性状态的样本进行测序，以便获得包含待分析微卫星位点的测序读段；（2）基于所获得的测序读段，采用下列两种方式至少之一进行微卫星位点的筛选：（a）将所述测序读段与参考序列进行比对，获得包含所述待分析微卫星位点的测序读段的读段数目及读段长度，获得目标微卫星位点；和（b）基于包含待分析微卫星位点的测序读段在所述已知微卫星稳定性状态的样本中的step‑wise difference值，获得目标微卫星位点。利用本发明的方法可以准确判断备选微卫星位点是否适合作为判定待检测样本微卫星稳定性的位点，使得所选择的微卫星位点可以准确判断待检测样本的微卫星稳定性的属性。