用于检测肿瘤突变负荷的序列组合和其设计方法
基本信息
| 申请号 | CN201811303219.3 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109427412B | 公开（公告）日 | 2022-02-15 |
| 申请公布号 | CN109427412B | 申请公布日 | 2022-02-15 |
| 分类号 | G16B20/00（2019.01）I;G16B25/00（2019.01）I;CN 103218543 A,2013.07.24;CN 106480205 A,2017.03.08;CN 108470114 A,2018.08.31;CN 108588194 A,2018.09.28;CN 108009400 A,2018.05.08 陈实富.循环肿瘤DNA测序的数据分析方法.《中国博士学位论文全文数据库》.2018,（第02期）,摘要、第15、19、44、45、46页.;Ferga C.Gleeson等.Somatic STK11 and Concomitant STK11/KRAS Mutational Frequency in Stage IV lung Adenocarcinoma Adrenal Metastases.《J Thorac Oncol》.2015,第531-534页. | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 易玉婷;管彦芳;田超;易鑫;杨玲 | 申请（专利权）人 | 北京吉因加科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京汇知杰知识产权代理有限公司 | 代理人 | 蔡伦;杨巍 |
| 地址 | 102206北京市昌平区回龙观镇中关村生命科学园北大医疗产业园6号楼9层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了用于检测肿瘤突变负荷的序列组合和其设计方法。所述方法包括：a）确定需要设计探针的目标区域，并获得包含大样本测定的肿瘤突变数据的数据库；b）对于每个目标区域，以一个窗口长度进行滑动获得多个窗口，对所述每个窗口进行打分；c）对于每个目标区域，得分最高的窗口是目标探针区域。本发明还公开了计算组织和血浆样本TMB的方法，以及计算组织和血浆样本TMB的质控方法。 |
