利用高通量测序数据分析基因融合的方法
基本信息
申请号 | CN201810062150.3 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN108304693B | 公开(公告)日 | 2022-02-25 |
申请公布号 | CN108304693B | 申请公布日 | 2022-02-25 |
分类号 | G16B30/10(2019.01)I;G16B20/00(2019.01)I | 分类 | 计算;推算;计数; |
发明人 | 张思文;田埂;梁羽 | 申请(专利权)人 | 元码基因科技(北京)股份有限公司 |
代理机构 | 北京科石知识产权代理有限公司 | 代理人 | 高元吉 |
地址 | 100102北京市朝阳区广顺北大街5号融创动力A区4层 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开一种利用高通量测序数据分析基因融合的方法。本发明使用pair‑end数据作为输入,对soft‑clip功能不作要求,而且不必需要设置多个复杂参数,根据比对信息和后续过滤条件,检测融合并保留融合的序列和位置,对于单端数据量1G的双端测序数据来说,单对融合基因的分析仅需不到一小时,且每增加一对融合基因的分析,仅需增加5至10分钟。 |
