利用高通量测序数据分析基因融合的方法

基本信息

申请号 CN201810062150.3 申请日 -
公开(公告)号 CN108304693B 公开(公告)日 2022-02-25
申请公布号 CN108304693B 申请公布日 2022-02-25
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B20/00(2019.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 张思文;田埂;梁羽 申请(专利权)人 元码基因科技(北京)股份有限公司
代理机构 北京科石知识产权代理有限公司 代理人 高元吉
地址 100102北京市朝阳区广顺北大街5号融创动力A区4层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开一种利用高通量测序数据分析基因融合的方法。本发明使用pair‑end数据作为输入,对soft‑clip功能不作要求,而且不必需要设置多个复杂参数,根据比对信息和后续过滤条件,检测融合并保留融合的序列和位置,对于单端数据量1G的双端测序数据来说,单对融合基因的分析仅需不到一小时,且每增加一对融合基因的分析,仅需增加5至10分钟。