确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组
基本信息
| 申请号 | CN202210115294.7 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN114150067B | 公开（公告）日 | 2022-05-17 |
| 申请公布号 | CN114150067B | 申请公布日 | 2022-05-17 |
| 分类号 | C12Q1/6886（2018.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 杨洲;张吉娜;刘金洋;张美俊;孙雪;王伟伟;田埂 | 申请（专利权）人 | 元码基因科技（北京）股份有限公司 |
| 代理机构 | 北京北汇律师事务所 | 代理人 | - |
| 地址 | 100102北京市朝阳区广顺北大街5号融创动力产业园A栋4层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开一种确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组。该方法为使用肿瘤单个样本且基于二代测序技术的方法，其包括以下步骤：（1）初步筛选得到由多个微卫星位点组成的候选位点集；和（2）计算候选位点集中各微卫星位点对于MSI状态的贡献度，并根据贡献度大小对候选位点集中的微卫星位点进行排序，取排名前n的微卫星位点组成筛选位点集，利用筛选位点集计算MSI‑H和MSS两组样本的样本MSI评分，根据样本评分得到所需的位点组合。本发明的位点组合不仅能够提高微卫星状态检测的准确度和灵敏度，同时大大降低单样本流程的检测成本。 |
