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一种检测微小残留病MRD的方法

基本信息

申请号	CN201811549203.0	申请日	-
公开（公告）号	CN109680062A	公开（公告）日	2019-04-26
申请公布号	CN109680062A	申请公布日	2019-04-26
分类号	C12Q1/6886（2018.01）I; C12N15/11（2006.01）I; C12Q1/6869（2018.01）I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	孙涛; 余莹莹; 张天骄	申请（专利权）人	杭州艾沐蒽生物科技有限公司
代理机构	北京中政联科专利代理事务所（普通合伙）	代理人	杭州艾沐蒽生物科技有限公司
地址	310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路浙江大学紫金港校区纳米楼231室
法律状态	-

摘要

本发明提供了一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症如T/B系白血病、淋巴瘤、骨髓瘤微小残留病的检测方法，该方法通过添加内参及House Keeping基因，采用带有UMB(Unique Molecular Barcode,单分子标签)的多重PCR引物组对样本分别进行IGH(VDJ)、IGH(DJ)、IGK、IGL、TCRβ、TCRγ、TCRδ、BCL1/IGH、BCL2/IGH的文库构建，将所得的DNA文库通过Illumina HiSeq平台进行测序，并通过生物信息学分析高通量测序结果。本方法在检测癌细胞的同时可发现新突变的癌细胞，并应用高通量测序技术结合生物信息学分析，MRD的检测灵敏度至少可在100万个细胞中检测到一个癌细胞，即10‑6(0.0001％)。本方法不仅可以定量分析癌细胞数量，达到微小残留病检测目的，而且可以纠正PCR扩增产生的碱基错配导致的序列突变和文库测序过程中产生的序列读取错误。