HPV 精确分型的生物信息学分析的方法及系统

基本信息

申请号 CN201080070484.7 申请日 -
公开(公告)号 CN103261442B 公开(公告)日 2014-12-10
申请公布号 CN103261442B 申请公布日 2014-12-10
分类号 C12Q1/70(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 刘智盛;田仕林;潘荣 申请(专利权)人 深圳市贵人资本投资有限公司
代理机构 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 代理人 孙宝海
地址 518083 广东省深圳市盐田区北山道146号北山工业区11栋二楼、三楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开一种HPV精确分型的生物信息学分析的方法及系统,该方法包括:接收高通量测序技术得到的测序片段;将测序片段中的样本接头序列与样本接头序列库进行比对,实现分样本操作;将测序片段与参考基因组序列进行比对,对比对后的序列进行筛选,确定筛选后的序列片段的HPV型别或阴性;对确定型别的序列片段按样本进行合并,并根据合并后支持对应型别的序列片段数量和比例进行筛选;最终确认每个样本的HPV型别或者确定为阴性。本发明提供的HPV精确分型的生物信息学分析的方法及系统,利用生物信息学的分析方法及技术手段,实现了快速检测大量样本、快速完成对感染HPV型别的检测,具有较高的灵敏度和特异性。