一种低质量FFPE DNA的处理方法、装置和存储介质
基本信息
| 申请号 | CN201911019643.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN110669830A | 公开（公告）日 | 2020-01-10 |
| 申请公布号 | CN110669830A | 申请公布日 | 2020-01-10 |
| 分类号 | C12Q1/6858（2018.01）; C12M1/00（2006.01）; C12M1/34（2006.01） | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 李艳; 朱嘉麒; 罗喜鹏; 陈超; 聂新华 | 申请（专利权）人 | 裕策医疗器械江苏有限公司 |
| 代理机构 | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 | 代理人 | 李小焦;彭愿洁 |
| 地址 | 225300 江苏省泰州市泰州医药高新技术产业园第五期标准厂房G129栋8层东及9层东 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本申请公开了一种低质量FFPE DNA的处理方法、装置和存储介质。本申请的处理方法包括，对FFPE DNA进行片段化处理，然后加热去除二级结构，再酶切消化；消化后末端修复、加poly A尾，并使用A碱基连接头；然后，进行PCR扩增，杂交捕获、测序，获得测序数据；将测序数据比对到人参考基因组，并从比对结果中过滤掉同时部分比对到同一染色体两个不同地方，且比对起始位置距离小于500bp的序列。本申请的方法，通过加热和酶切消化，消除大部分单链，使其不能相互连接后在末端补平中形成稳定双链，减少了因单链残留造成后续突变检测的假阳性；通过数据比对和过滤，进一步去除单链干扰，提高了突变检测结果的准确性。 |
