一种BCR免疫组库全长扩增的三代建库测序方法

基本信息

申请号 CN202010603495.2 申请日 -
公开(公告)号 CN111662970A 公开(公告)日 2020-09-15
申请公布号 CN111662970A 申请公布日 2020-09-15
分类号 C12Q1/6869(2018.01)I;C40B50/06(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 方涛 申请(专利权)人 武汉菲沙基因信息有限公司
代理机构 上海精晟知识产权代理有限公司 代理人 武汉菲沙基因信息有限公司
地址 430000湖北省武汉市东湖高新技术开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B1栋
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种BCR免疫组库全长扩增的三代建库测序方法,步骤包括:1)根据BCR一致性序列的恒定区设计与合成引物;2)通过Oligo dT引物和BCR Template Switching Oligo引物的作用下合成第一链cDNA;3)BCR cDNA的全长第一轮和第二轮的扩增;4)BCR全长扩增子片段混样;5)文库构建;6)进行三代测序。本发明通过在BCR恒定区的保守区域设计多重引物,覆盖整个BCR的全长序列。在进行BCR序列扩增时,为进一步提高3’端扩增的有效性,设计了多组半巢式引物,通过半巢式引物的匹配筛选即可获得覆盖整个BCR全长的扩增子片段。通过PacBio建库流程,在扩增子的两端添加带有barcode的测序接头,即可进行PacBio测序,通过拆分与数据校正后获得准确率在99%以上的HiFi Reads。