一种基于新冠病毒特异性逆转录引物的建库方法及运用

基本信息

申请号 CN202010537252.3 申请日 -
公开(公告)号 CN111647644A 公开(公告)日 2020-09-11
申请公布号 CN111647644A 申请公布日 2020-09-11
分类号 C12Q1/6806(2018.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 方涛 申请(专利权)人 武汉菲沙基因信息有限公司
代理机构 上海精晟知识产权代理有限公司 代理人 武汉菲沙基因信息有限公司
地址 430000湖北省武汉市东湖高新技术开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B1栋
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于新冠病毒特异性逆转录引物的建库方法,其步骤包括:1)基于新冠病毒一致性序列设计15条特异性逆转录引物;2)基于Tn5VR转座酶对新冠病毒建库测序。本发明另外还公开了该建库方法的运用。本发明针对新冠病毒的高保守区域设计特异性逆转录引物,选择性的逆转录新冠病毒的RNA,从而实现对病毒RNA的特异性富集,提高测序数据中病毒序列的占比。同时,本发明采用特异性的转座酶建库方法,该转座酶仅可切割DNA与RNA杂合链,并在切割位置添加接头序列,实现直接从DNA‑RNA杂合链起始的建库测序方法,可以避免存在的基因组DNA污染,同时可以将建库的起始量量降低至1ng以下,实现超微量的新冠病毒测序。