一对HLA等位基因中两个等位基因表达量的定量检测方法
基本信息
申请号 | CN202010501363.9 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN111607640A | 公开(公告)日 | 2020-09-01 |
申请公布号 | CN111607640A | 申请公布日 | 2020-09-01 |
分类号 | C12Q1/6881(2018.01)I;C12Q1/6851(2018.01)I | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 李丛;周一鸣 | 申请(专利权)人 | 角井(北京)生物技术有限公司 |
代理机构 | 北京汉鼎理利专利代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人 | 北京新抗元生物技术有限公司 |
地址 | 102206北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢B316-12室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供一对HLA等位基因中两个等位基因表达量的定量检测方法,所述方法应用于二倍体生物中个性化HLA的检测,所述检测方法包括将所述测序数据的reads的长度作为需要构建的Kmer长度m,分别得到每个等位基因的所有Kmer,过滤掉每个等位基因中非特有的Kmer,得到一对HLA等位基因中每个等位基因特有的Kmer,和统计一对HLA等位基因中两个等位基因中每个等位基因特有的reads数量,得到该对HLA等位基因中两个等位基因表达量及其表达的比例。 |
