一种使用高通量DNA杂交芯片的人类Y染色体SNP分型方法
基本信息
申请号 | CN201810686653.8 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN108841968A | 公开(公告)日 | 2018-11-20 |
申请公布号 | CN108841968A | 申请公布日 | 2018-11-20 |
分类号 | C12Q1/6888;C12Q1/6837;C12Q1/6858 | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 陈宁;王翠红;梁冰冰;赵南 | 申请(专利权)人 | 北京水母科技有限公司 |
代理机构 | - | 代理人 | - |
地址 | 100176 北京市大兴区经济技术开发区科创十三街18号院8号楼402-B | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种使用高通量DNA杂交芯片的人类Y染色体SNP分型方法,基于Y染色体SNP检测需求,进行位点同源性比对,同时对比数据库中已验证位点;根据设计好的芯片进行生产;将从受试者处采集的唾液或口腔拭子样本进行gDNA的提取;根据Axiom芯片检测流程,自动化进行芯片制备;使用GeneTitan MC仪器对制备好的基因芯片进行扫描;使用软件对基因芯片扫描结果进行分析,计算各检测SNP位点的基因型;基于检测得到的SNP分型结果,根据ISOGG Y‑DNA树计算Y‑DNA单倍群。本发明杂交SNP芯片在Y染色体的应用具有核酸制备、检测成本低,SNP定制位点灵活,测出率高,降低了原有对家族、姓氏等研究中由于改姓、入赘等带来的结果的不确定性,实验检测所需的gDNA量较低,检测成本更低。 |
