一种基于纳米孔测序仪的高精度快速测序平台及其搭建方法

基本信息

申请号 CN202110636773.9 申请日 -
公开(公告)号 CN113570495A 公开(公告)日 2021-10-29
申请公布号 CN113570495A 申请公布日 2021-10-29
分类号 G06T1/20(2006.01)I;G06F8/71(2018.01)I;G06F8/65(2018.01)I;G06F8/61(2018.01)I;G16B30/00(2019.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 谷红仓;徐振宇;王云飞;车仙荣 申请(专利权)人 杭州圣庭医疗科技有限公司
代理机构 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于纳米孔测序仪的高精度快速测序平台及其搭建方法,属于分子生物领域,搭建测序平台方法包括:测序平台硬件设备,测序平台软件安装,测序平台系统配置;硬件设备包括:CPU,GPU,SSD;测序平台软件包括:ubuntu 18.04 LTS,CUDA,GUPPY,MinKNOW;测序平台系统配置包括:配置CUDA环境变量,配置MinKNOW运行参数,配置GUPPY和配置软件自动升级;本发明通过硬件的选取和测序软件环境整合解决了现有技术中三代Nanopore测序碱基判读耗时长且准确度不高的问题,具有广泛的临床潜力。