一种利用福尔马林固定石蜡包埋样本快速构建RRBS测序文库的方法

基本信息

申请号 CN202111060933.6 申请日 -
公开(公告)号 CN113550013A 公开(公告)日 2021-10-26
申请公布号 CN113550013A 申请公布日 2021-10-26
分类号 C40B50/06(2006.01)I 分类 组合技术〔8〕;
发明人 谷红仓;王云飞;车仙荣;陶宛琪;钱飞箭 申请(专利权)人 杭州圣庭医疗科技有限公司
代理机构 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种利用福尔马林固定石蜡包埋样本快速构建RRBS测序文库的方法,属于分子生物学领域,本发明包括如下步骤:步骤一,取石蜡包埋的组织样本,获得基因组DNA;用末端修饰酶加ddATP修复;步骤二,采用限制性内切酶消化基因组DNA的CpG岛;步骤三,用末端修饰酶对基因组DNA进行末端修复并在3’端加A‑Tailing;步骤四,用DNA连接酶进行甲基化接头连接,混合样本;步骤五,采用亚硫酸氢盐转化非甲基化胞嘧啶;步骤六,甲基化文库PCR富集;步骤七,切胶回收;本发明解决了现有技术福尔马林浸泡造成的RRBS构建FFPE DNA文库失败率高的问题,具有广大的应用前景和市场价值。