一种基于Nanopore测序仪进行结核分枝杆菌耐药检测分析系统及其构建方法
基本信息
申请号 | CN202110673816.0 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN113674801A | 公开(公告)日 | 2021-11-19 |
申请公布号 | CN113674801A | 申请公布日 | 2021-11-19 |
分类号 | G16B20/50(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B50/10(2019.01)I;G16B50/30(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 谷红仓;谢长校;徐振宇;王云飞;车仙荣 | 申请(专利权)人 | 杭州圣庭医疗科技有限公司 |
代理机构 | 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 魏亮 |
地址 | 311113浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种基于Nanopore测序仪进行结核分枝杆菌耐药检测分析系统及其构建方法,属于基因检测分析领域,系统包括:微生物序列参考库模块、结核分枝杆菌耐药参考库模块、病原微生物鉴定模块、突变检测模块和耐药数据库注释模块;基于该系统的构建方法包括:构建数据比对的微生物序列参考库,将测序数据比对到微生物序列参考库并鉴定病原微生物,构建用于突变注释的结核分枝杆菌耐药参考库,将来源于结核分枝杆菌的序列比对到结核分枝杆菌参考基因组并鉴定基因突变,将结核分枝杆菌的基因突变位点与结核分枝杆菌耐药参考库关联分析突变位点的耐药性质;本系统能够快速鉴定病原微生物和检测结核分枝杆菌耐药性质,且灵敏度和特异性高。 |
