一种基于纳米孔测序仪的分枝杆菌快速鉴定方法
基本信息
申请号 | CN202110836894.8 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN113667728A | 公开(公告)日 | 2021-11-19 |
申请公布号 | CN113667728A | 申请公布日 | 2021-11-19 |
分类号 | C12Q1/6869(2018.01)I;C12Q1/689(2018.01)I;C12Q1/04(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C12R1/32(2006.01)N | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 谷红仓;陶春豪;许佩松;王云飞;车仙荣 | 申请(专利权)人 | 杭州圣庭医疗科技有限公司 |
代理机构 | 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 魏亮 |
地址 | 311113浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种基于纳米孔测序仪的分枝杆菌快速鉴定方法,属于分子生物学领域,本发明包括如下步骤:步骤一,设计结核分枝杆菌插入序列IS6110、hsp65、rpoB、16S rRNA、gyrB基因待测区域的特异性引物;步骤二,得到含有特定碱基序列的引物并混合形成引物池;步骤三,合成Barcode引物;步骤四,提取基因组DNA;步骤五,第一轮扩增并纯化;步骤六,第二轮扩增并纯化;步骤七,构建测序文库并纯化;步骤八,使用纳米测序仪测序,对数据进行质控分析后,进行数据分析;本发明通过找到这5种靶基因组合的扩增引物,使扩增序列能对分枝杆菌不同菌种进行鉴定区分,实现快速、准确、灵敏的鉴定分歧杆菌。 |
