一种基于纳米孔测序仪的分枝杆菌快速鉴定方法

基本信息

申请号 CN202110836894.8 申请日 -
公开(公告)号 CN113667728A 公开(公告)日 2021-11-19
申请公布号 CN113667728A 申请公布日 2021-11-19
分类号 C12Q1/6869(2018.01)I;C12Q1/689(2018.01)I;C12Q1/04(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C12R1/32(2006.01)N 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 谷红仓;陶春豪;许佩松;王云飞;车仙荣 申请(专利权)人 杭州圣庭医疗科技有限公司
代理机构 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于纳米孔测序仪的分枝杆菌快速鉴定方法,属于分子生物学领域,本发明包括如下步骤:步骤一,设计结核分枝杆菌插入序列IS6110、hsp65、rpoB、16S rRNA、gyrB基因待测区域的特异性引物;步骤二,得到含有特定碱基序列的引物并混合形成引物池;步骤三,合成Barcode引物;步骤四,提取基因组DNA;步骤五,第一轮扩增并纯化;步骤六,第二轮扩增并纯化;步骤七,构建测序文库并纯化;步骤八,使用纳米测序仪测序,对数据进行质控分析后,进行数据分析;本发明通过找到这5种靶基因组合的扩增引物,使扩增序列能对分枝杆菌不同菌种进行鉴定区分,实现快速、准确、灵敏的鉴定分歧杆菌。