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参考蛋白质数据库的构建方法、存储介质、电子设备

基本信息

申请号 CN202110662956.8 申请日 -
公开（公告）号 CN113393903A 公开（公告）日 2021-09-14
申请公布号 CN113393903A 申请公布日 2021-09-14
分类号 G16B50/00（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I;G16B20/50（2019.01）I 分类 物理
发明人 戚良 申请（专利权）人 上海君谊生物科技有限公司
代理机构 上海隆天律师事务所 代理人 钟宗
地址 200072上海市静安区汶水路40号39幢3层331室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明属于生物技术领域，特别涉及一种参考蛋白质数据库的构建方法，包括如步骤：S2、获取公共数据库中的SNP位点信息,对SNP位点进行筛选，得到导致编码氨基酸改变的SNP位点列表；S3、在SNP位点列表中根据样品的蛋白丰度筛选出表达量高的蛋白质的SNP位点；S4、生成筛选后的SNP位点列表对应的可遗传变异肽，将所述可遗传变异肽加入公共蛋白质数据库的参考蛋白质序列，以生成基于样品的参考蛋白质数据库，所述参考蛋白数据库包含所述可遗传变异肽。本发明的参考蛋白质数据库基于样品，从而避免错误去除蛋白质而产生的误差，提高有效数据完整性，也不会导致纳入过多的遗传变异信息造成高度冗余性。