一种基于matK基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库

基本信息

申请号 CN202010319607.1 申请日 -
公开(公告)号 CN111681704B 公开(公告)日 2022-06-17
申请公布号 CN111681704B 申请公布日 2022-06-17
分类号 G16B20/00(2019.01)I;G06K9/62(2022.01)I;G16B50/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 宁康;白虹;杨朋硕;卢璟详;邹欣桐;李洪军 申请(专利权)人 华中科技大学鄂州工业技术研究院
代理机构 北京众达德权知识产权代理有限公司 代理人 -
地址 436044湖北省鄂州市梧桐湖新区凤凰大道特一号
法律状态 -

摘要

摘要 一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库,所述方法包括步骤:获取含有matk基因的原始序列数据文件;提取所述原始序列数据文件中的物种注释信息;将所述物种注释信息整合至所述matK基因上,以得到matK序列;对所述matk序列进行质量控制;根据所述matk序列之间的相似性进行聚类;根据聚类结果构建所述数据库。本申请提供的一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库优点为:(1)检测通量高;(2)高灵敏度和选择性;(3)该方法所构建的数据库覆盖面广、数据质量高、信息全面;(4)可以利用生物信息学方法在物种的水平上确定未知物种。