一种基于matK基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库
基本信息
申请号 | CN202010319607.1 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN111681704B | 公开(公告)日 | 2022-06-17 |
申请公布号 | CN111681704B | 申请公布日 | 2022-06-17 |
分类号 | G16B20/00(2019.01)I;G06K9/62(2022.01)I;G16B50/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 宁康;白虹;杨朋硕;卢璟详;邹欣桐;李洪军 | 申请(专利权)人 | 华中科技大学鄂州工业技术研究院 |
代理机构 | 北京众达德权知识产权代理有限公司 | 代理人 | - |
地址 | 436044湖北省鄂州市梧桐湖新区凤凰大道特一号 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库,所述方法包括步骤:获取含有matk基因的原始序列数据文件;提取所述原始序列数据文件中的物种注释信息;将所述物种注释信息整合至所述matK基因上,以得到matK序列;对所述matk序列进行质量控制;根据所述matk序列之间的相似性进行聚类;根据聚类结果构建所述数据库。本申请提供的一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库优点为:(1)检测通量高;(2)高灵敏度和选择性;(3)该方法所构建的数据库覆盖面广、数据质量高、信息全面;(4)可以利用生物信息学方法在物种的水平上确定未知物种。 |
