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基于多模态深度编码的抗原免疫原性预测方法和系统

基本信息

申请号 CN202111204465.5 申请日 -
公开（公告）号 CN113762416A 公开（公告）日 2021-12-07
申请公布号 CN113762416A 申请公布日 2021-12-07
分类号 G06K9/62（2006.01）I;G06N3/04（2006.01）I;G06N3/08（2006.01）I;G16B30/10（2019.01）I 分类 计算；推算；计数;
发明人 费才溢;徐实 申请（专利权）人 南京澄实生物科技有限公司
代理机构 南京天华专利代理有限责任公司 代理人 刘畅;傅婷婷
地址 210000江苏省南京市江北新区探秘路73号树屋十六栋D-2栋2层209室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于多模态深度编码的抗原免疫原性预测方法和系统，包括：1）包含较全面HLA等位基因个数；2）可变长肽段编码方式，涵盖主要HLA‑I结合肽段长度；3）考虑抗原受体谱系对肽段免疫原性的影响；4）包含肽段和MHC序列的物理和氨基酸组成特征；5）多模态特征融合得到预测分数并进行预测。不同于以往的仅基于生物实验或较单一化的数据模态的预测模型，本系统方案能高效地融合多模态信息，进行更加准确高效的预测。基于真实数据结果表面，其TOP‑10结果具有较高水平的PPV值，能够更好的应用在真实的药物研发生产环境。