应用于组织样本中染色体开放结合区域定位的ATAC-seq方法
基本信息
| 申请号 | CN201711414078.8 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN108018345A | 公开（公告）日 | 2018-05-11 |
| 申请公布号 | CN108018345A | 申请公布日 | 2018-05-11 |
| 分类号 | C12Q1/6869;G06F19/22 | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 李旦 | 申请（专利权）人 | 上海嘉因生物科技有限公司 |
| 代理机构 | - | 代理人 | - |
| 地址 | 200000 上海市杨浦区国伟路135号10号楼305室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及应用于组织样本中染色体开放结合区域定位的ATAC‑seq方法，包括细胞悬液制备、转座反应与纯化、去除杂质、PCR扩增、高通量测序、概率检测。该方法采用转座酶法进行DNA片段化，将繁琐的DNA片段化、末端修复和接头连接反应等步骤变为一步简单的酶促反应，缩短实验时间。可以快速的得到调控的多维信息，比其他方法要节省大约3到5个数量级的细胞。实验流程中没有片段选择的步骤，所以这种方法可以同时获得“开放”染色质的位置、转录因子的结合位点、核小体的调控区域和染色质状态等信息。 |
