应用于组织样本中染色质超敏感位点DNaseI酶切优化方法
基本信息
申请号 | CN201711414081.X | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN108034704A | 公开(公告)日 | 2018-05-15 |
申请公布号 | CN108034704A | 申请公布日 | 2018-05-15 |
分类号 | C12Q1/6869;G06F19/24 | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 李旦 | 申请(专利权)人 | 上海嘉因生物科技有限公司 |
代理机构 | - | 代理人 | - |
地址 | 200000 上海市杨浦区国伟路135号10号楼305室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明涉及应用于组织样本中染色质超敏感位点DNase I酶切优化方法,包括提取细胞核、酶切反应、回收DNA片段、数据预处理和可靠性检验。首先,对组织的细胞核的前期收集方法进行改进,并通过细胞核的数量,优化酶切反应条件,提高了DNase I的酶切效率。其次,采用DNase I的酶切方法与高通量方法的结合,不仅能够有效的获取正确的染色质片段,而且能够降低由于前期研磨样本产生的假阳性,能够在精准定位转录调控元件在全基因组上的结合位点,提高了临床样本的研究进程。最后,还对高通测序数据的可靠性进行检验。 |
