癌症筛查模型、癌症筛查模型的构建方法及构建装置

基本信息

申请号 CN202110707095.0 申请日 -
公开(公告)号 CN113257360A 公开(公告)日 2021-08-13
申请公布号 CN113257360A 申请公布日 2021-08-13
分类号 G16B40/20(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I;G16H50/20(2018.01)I;G16H50/70(2018.01)I;G06K9/62(2006.01)I 分类 物理
发明人 曹善柏;周涛;张萌萌;郭璟;孙宏;楼峰 申请(专利权)人 天津橡鑫生物科技有限公司
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 代理人 金田蕴
地址 102600北京市大兴区经济技术开发区科创十三街18号院5号楼16层1601
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种癌症筛查模型、癌症筛查模型的构建方法及构建装置。该构建方法包括以下步骤:基于不同的数据构建不同的CNV baseline;分别利用不同的CNV baseline对待检测样本的sWGS数据进行CNV检测,获取多个基因组特征;利用待检测样本的sWGS数据建立训练集与测试集,将各个基因组特征的数值做ROC曲线,选择AUC值最大的基因组特征作为最终基因组特征;对最终基因组特征进行模型训练,获得癌症筛查模型。本发明通过纳入sWGS情况下,基于不同baseline数据获得多个基因组特征,建立训练集与测试集,通过机器学习的方法,建立癌症筛查模型,提高癌症(早期)筛查的准确性。