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基于Sanger测序的HLA分型方法及设备

基本信息

申请号 CN202011600233.7 申请日 -
公开（公告）号 CN112669903A 公开（公告）日 2021-04-16
申请公布号 CN112669903A 申请公布日 2021-04-16
分类号 G16B20/30 分类 物理
发明人 郭同垒;何胜;刘明坤;叶锋 申请（专利权）人 北京旌准医疗科技有限公司
代理机构 北京细软智谷知识产权代理有限责任公司 代理人 付登云
地址 102600 北京市大兴区北京经济技术开发区经海四路156号院14号楼4层
法律状态 -

摘要

摘要 本申请涉及一种基于Sanger测序的HLA分型方法及设备，包括：获取待识别基因的测序数据；根据待识别基因的测序数据，基于预先训练的碱基识别模型，得到待识别基因各位点的正确碱基信号；判读所述待识别基因的核酸序列并与参考序列比对获得差异位点，基于预先整理的等位基因型与所述差异位点，采用位运算比较获得HLA分型结果。由于碱基识别模型以非正常碱基的测序数据作为样本数据进行训练，训练得到的碱基识别模型可以对Sanger测序数据中存在的低质量、杂合碱基和污染信号等非正常碱基进行识别，使用位运算快速获得等位基因型分型结果，解决了人工进行识别速度慢、准确性低的问题。