中国科学院国家空间科学中心成立于2011年6月，当时依托于中国科学院院设的非法人研究单元中国科学院空间科学与应用研究中心，与中国科学院空间科学与应用研究中心“一个机构两块牌子”。2015年6月，中央编办批复同意中国科学院空间科学与应用研究中心更名为中国科学院国家空间科学中心。 中国科学院国家空间科学中心是中国空间科学及其卫星工程项目的总体性研究机构，面向全中国的空间科学创新平台，负责组织开展国家空间科学发展规划研究，具体负责中国科学院空间科学先导专项的组织与实施，开展空间科学及相关应用领域的创新性科学与技术研究工作，为空间科学先导专项及未来发展提供科学与技术支撑，引领空间科学发展，带动空间技术创新。 截至2015年7月，该中心共有在职职工697人（其中科技人员477人、 科技支撑人员150人）；建设有1个国家重点实验室和2个中国科学院重点实验室；共有在站博士后13人，在学研究生354名，其中博士生152人，硕士生202人。