新疆农资(集团)有限责任公司前身是新疆维吾尔自治区农业生产资料集团公司。该公司经新疆维吾尔自治区经济体制改革委员会批准,根据新疆维吾尔自治区供销合作社联合社(以下简称"自治区供销社")改革经营机制的实施意见,于1993年1月4日成立。在1998年之前农资产品由自治区供销社系统专营,本公司是计划经济时代新疆维吾尔自治区一级批发企业,1999年以后,为适应市场经济的要求,政府放开了部分农资产品经销渠道,并深化了国有企业体制改革。 2001年12月,经自治区供销社批准,并由自治区供销社出资控股,联合新疆新化化肥有限责任公司、新疆棉花产业(集团)有限责任公司、新疆供销对外经济贸易公司、新疆农资流通协会、本公司工会职工持股会等六家股东共同发起,新疆维吾尔自治区农业生产资料集团公司整体改制为有限责任公司,并更名为"新疆农资(集团)有限责任公司"。