中国水产科学研究院长江水产研究所是中国水产科学重点研究机构之一，隶属于农业部。1958年在南京成立中华人民共和国水产部长江水产研究所，先后更名为湖北省长江水产研究所、国家水产总局长江水产研究所、中国水产科学研究院长江水产研究所沙市分所，1984年定名为中国水产科学研究院长江水产研究所。 研究所围绕濒危水生动物保护、水产种质源保存和遗传育种、渔业资源保护与利用、渔业环境评价与保护、水产养殖、鱼类病害防控、鱼类营养与饲料、水产品质量安全、池塘生态工程等领域开展研究。 据2018年1月研究所官网显示，长江所实有工作人员249人，其中编制内181人、编制外68人；拥有1个农业部重点实验室、1个农业部监督检验测试中心、1个农业部重点野外科学观测试验站、1个农业部生态环境监测中心、1个农业部监测站、1个农业部放流中心、1个中国水产科学院重点开放实验室；设有1个博士后科研工作站。