北京国环清华环境工程设计研究院有限公司是清华大学从事环境工程设计与咨询的全资设计单位。设计院最初成立于1981年，原名为“清华大学环境工程研究所”。1993年更名为“国家环保局清华大学环境工程设计研究院”。1998年，正式注册成立“北京国环清华环境工程设计研究院”，成为清华大学全资的独立法人单位。2009年，设计院根据教育部的有关规定进行了改制，名称变更为“北京国环清华环境工程设计研究院有限公司”。设计院是清华大学重要的环境领域社会服务平台，其技术主要依托于环境科学与工程系，拥有国内一流的专业技术人员和专业技术装备，现有工程技术人员200余人，专业配备合理，具有丰富的环境咨询、工程咨询、设计和运营经验。设计院高度重视环保技术的开发与创新，力求及时高效地把清华大学环境领域的最新研究成果应用到工程实践中。业务领域广泛，在城市污水处理与资源化、高浓度有机废水处理、难降解有机废水处理、中水回用技术、水源水保护及给水处理、固体废弃物处理与资源化、危险废物处置处理、医疗垃圾处理、环境规划与管理、环境影响评价等领域有着丰富的工程经验和良好的业绩。设计院配合清华大学环境科学与工程系完成了多项工程领域的重大课题，并作为主要负责单位独立承担了数项国家重大科研项目。迄今为止，设计院已经完成了数千项环境与市政工程设计和环境咨询项目，取得了多项国家及省部级奖励，同时拥有一批环境污染控制的专利技术。