南京理工大学连云港研究院成立于2011年7月16日，由南京理工大学和连云港市合作共建。根据协议共建的产学研基地是连云港市人民政府、南京理工大学两方合作，相关单位和企业参与共建、市场化运营的研发和公共服务机构，立足于全面服务连云港市，并辐射沿海及周边区域，旨在以新材料、新能源、新医药、物联网、装备制造、现代物流等技术为重点，与连云港市企事业单位共同申报、承担国家和省部级重大项目；通过在职人员的研究生学历培养，全面提升连云港高等教育的层次和水平；结合连云港的产业基础和经济发展战略，选择一批优质科技成果在连云港进行孵化及产业化。