2001年12月3日,经武汉市科学技术局武科政[2001]242号文批复,被认定为高新技术企业。 2002年8月8日,获得挪威船级社颁发的ISO9001:2000证书。 2004年12月,经国资委批准,将武汉公司持有的85.51%股份无偿划拨到中国长江航运(集团)总公司。2006年6月,经国资委和中国证监会批准,长航集团将上述股份通过资产置换方式,投入长航凤凰股份有限公司。 湖北省武汉市中级人民法院于2014年3月31日裁定受理债权人对公司控股子公司长江交通科技股份有限公司的破产清算申请,并于同日指定长江交科清算组担任长江交科管理人。